Los principales resultados obtenidos del seguimiento ornitológico han sido:
• 102 especies de aves (48 no passeriformes y 54 passeriformes) fueron observadas en el río duante el año 2008.
• 19 especies observadas en 2007 no fueron avistadas en 2008.
• 9 especies con un grado de amenaza nidifican en el entorno del río: Martinete, Martín pescador, Chorlitejo chico, Zarcero pálido, Alcaudón común, Avetorillo, Avión zapador, Golondrina dáurica y Rascón.
• El entorno del Balcón del Guadalquivir y del Molino de Martos destacan por su importancia para las aves acuáticas y palustres, siendo con mucha diferencia el mejor hábitat registrado del río a su paso por Córdoba para ese grupo de aves.
• Los Sotos de la Albolafia albergan colonias y dormideros destacables de ardeidas (garzas y afines) y de cormoranes.
• El bosque de ribera en fase de maduración está en el proceso de favorer a las aves forestales en detrimento de las aves palustres.
• Considerando los márgenes terrestres del río, el uso del suelo agrícola favorece más la avifauna que el centro urbano, destacando asimismo la importancia de conservar esos pulmones de la ciudad.
• La figura de Monumento Natural de los Sotos de la Albolafia protege una fracción insuficiente del río para la conservación a largo plazo de la comunidad de aves presente, en especial las aves reproductoras amenazadas.